Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc22a28B2RT89 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms