Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ythdc2B2RR83 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms