Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms