Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpruB1AUH1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpruB1AUH1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms