Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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