Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930435E12RikA6X8Z9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms