Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Plcb2A3KGF7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Plcb2A3KGF7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.9 ms