Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms