Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4931406B18RikA2RSL7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms