Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms