Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Upf2A2AT37 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Upf2A2AT37 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Upf2A2AT37 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Upf2A2AT37 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upf2A2AT37 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upf2A2AT37 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upf2A2AT37 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upf2A2AT37 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upf2A2AT37 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upf2A2AT37 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upf2A2AT37 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upf2A2AT37 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upf2A2AT37 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upf2A2AT37 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upf2A2AT37 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Upf2A2AT37 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Upf2A2AT37 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf2A2AT37 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms