Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms