Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34dA2AGU5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34dA2AGU5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34dA2AGU5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34dA2AGU5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34dA2AGU5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34dA2AGU5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34dA2AGU5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34dA2AGU5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34dA2AGU5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34dA2AGU5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn34dA2AGU5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms