Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Frmpd4A2AFR3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Frmpd4A2AFR3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms