Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms