Protein–RNA interactions for Protein: A2AED3

Fndc7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc7A2AED3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc7A2AED3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc7A2AED3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc7A2AED3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc7A2AED3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms