Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Krtap29-1A2A5X4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms