Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm27029A2A4P4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms