Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms