Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc173A0JLY1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms