Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YE38

4932443I19Rik, RIKEN cDNA 4932443I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4932443I19RikA0A286YE38 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4932443I19RikA0A286YE38 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms