Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms