Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4921501E09RikA0A0R4J054 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4921501E09RikA0A0R4J054 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms