Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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