Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JEU3

Trdc, T cell receptor delta, constant region (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdcA0A0G2JEU3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TrdcA0A0G2JEU3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrdcA0A0G2JEU3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrdcA0A0G2JEU3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrdcA0A0G2JEU3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrdcA0A0G2JEU3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TrdcA0A0G2JEU3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TrdcA0A0G2JEU3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms