Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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