Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms