Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G7

Trbv1, T cell receptor beta, variable 1 (Fragment), mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv1A0A0B4J1G7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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