Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28360A0A087WR25 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28360A0A087WR25 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms