Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
2210011C24RikA0A087WQ89 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms