Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trbv31A0A075B5J5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trbv31A0A075B5J5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trbv31A0A075B5J5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trbv31A0A075B5J5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trbv31A0A075B5J5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trbv31A0A075B5J5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trbv31A0A075B5J5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trbv31A0A075B5J5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trbv31A0A075B5J5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trbv31A0A075B5J5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Trbv31A0A075B5J5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Trbv31A0A075B5J5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Trbv31A0A075B5J5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Trbv31A0A075B5J5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Trbv31A0A075B5J5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv31A0A075B5J5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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