Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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Col5a3Q9JLI2 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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