Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn19Q9ET38 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn19Q9ET38 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn19Q9ET38 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn19Q9ET38 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn19Q9ET38 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn19Q9ET38 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn19Q9ET38 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn19Q9ET38 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn19Q9ET38 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn19Q9ET38 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms