Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx8Q8CFD4 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms