Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim35Q8C006 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim35Q8C006 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim35Q8C006 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim35Q8C006 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim35Q8C006 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim35Q8C006 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim35Q8C006 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim35Q8C006 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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Trim35Q8C006 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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Trim35Q8C006 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim35Q8C006 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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