Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 4932431L22Rik-201ENSMUST00000193456 3140 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm13748-201ENSMUST00000149820 378 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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