Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm7093-201ENSMUST00000223004 581 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Olfr145-202ENSMUST00000213688 6691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Olfr1286-202ENSMUST00000184954 3398 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
ptchd1Q14B62 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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ptchd1Q14B62 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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ptchd1Q14B62 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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ptchd1Q14B62 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 AC140397.1-201ENSMUST00000225563 4562 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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ptchd1Q14B62 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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ptchd1Q14B62 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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ptchd1Q14B62 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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ptchd1Q14B62 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Vmn1r172-201ENSMUST00000038694 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Olfr1280-203ENSMUST00000219291 6883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm37887-201ENSMUST00000192752 2716 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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