Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm22360-201ENSMUST00000179775 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm24978-201ENSMUST00000179782 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm24967-201ENSMUST00000179791 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm22288-201ENSMUST00000179904 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm22645-201ENSMUST00000180010 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm23805-201ENSMUST00000180129 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm23512-201ENSMUST00000180237 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm25327-201ENSMUST00000180263 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm26058-201ENSMUST00000180294 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm22418-201ENSMUST00000180326 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm23629-201ENSMUST00000082465 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm23924-201ENSMUST00000082474 108 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm22246-201ENSMUST00000082478 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm22749-201ENSMUST00000082490 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm22747-201ENSMUST00000082495 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm22063-201ENSMUST00000082560 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm23057-201ENSMUST00000082801 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm26328-201ENSMUST00000082821 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm26331-201ENSMUST00000082824 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm24205-201ENSMUST00000082953 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm25405-201ENSMUST00000082973 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm22628-201ENSMUST00000082988 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm26324-201ENSMUST00000083073 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm24535-201ENSMUST00000083140 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm26496-201ENSMUST00000083150 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm26127-201ENSMUST00000083193 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm24456-201ENSMUST00000083198 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm24458-201ENSMUST00000083204 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm24018-201ENSMUST00000083232 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm25790-201ENSMUST00000083293 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm22295-201ENSMUST00000083311 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm25127-201ENSMUST00000083336 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm25583-201ENSMUST00000083413 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm25577-201ENSMUST00000083414 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm24414-201ENSMUST00000083434 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm24861-201ENSMUST00000083459 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm24803-201ENSMUST00000083693 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm23103-201ENSMUST00000083725 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm22580-201ENSMUST00000083727 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm24260-201ENSMUST00000083741 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm23732-201ENSMUST00000083751 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm22682-201ENSMUST00000083854 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm25869-201ENSMUST00000083855 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm24693-201ENSMUST00000083885 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm26317-201ENSMUST00000083894 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm24448-201ENSMUST00000083979 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm22798-201ENSMUST00000083992 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm26427-201ENSMUST00000093648 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm22170-201ENSMUST00000097247 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Ddx60-202ENSMUST00000093485 5989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm38332-201ENSMUST00000194189 147 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cntn3Q07409 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Cntn3Q07409 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
Cntn3Q07409 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms