Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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Opn1mwO35599 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm43958-201ENSMUST00000204360 3544 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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