Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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Znf580Q9DB38 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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Znf580Q9DB38 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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Znf580Q9DB38 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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Znf580Q9DB38 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Gm4788-201ENSMUST00000027612 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Gm5127-202ENSMUST00000101297 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Vmn2r91-201ENSMUST00000172359 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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Znf580Q9DB38 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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Znf580Q9DB38 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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Znf580Q9DB38 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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Znf580Q9DB38 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Nap1l1-202ENSMUST00000171797 3926 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Nap1l1-204ENSMUST00000218828 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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Znf580Q9DB38 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Znf580Q9DB38 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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