Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm11490-201ENSMUST00000118128 272 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms