Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm45539-201ENSMUST00000210313 428 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.7 ms