Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NelfeP19426 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NelfeP19426 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NelfeP19426 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NelfeP19426 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NelfeP19426 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms