Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms