Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ccdc18Q640L5 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Ccdc18Q640L5 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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