Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Nell1os-203ENSMUST00000152166 410 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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Sox12Q04890 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sox12Q04890 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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Sox12Q04890 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Gm18441-201ENSMUST00000223539 617 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Tmem71-201ENSMUST00000048372 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sox12Q04890 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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