Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Hoxd10P28359 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd10P28359 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms