Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm15263-201ENSMUST00000121556 642 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Hoxd9P28357 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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