Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Olfr1286-202ENSMUST00000184954 3398 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Limd1Q9QXD8 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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