Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Olfr1309-206ENSMUST00000217452 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm25821-201ENSMUST00000093657 133 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Olfr145-202ENSMUST00000213688 6691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Olfr1258-203ENSMUST00000213720 7098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm29097-201ENSMUST00000190273 422 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Olfr91-203ENSMUST00000217372 3809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 A830011K09Rik-202ENSMUST00000162868 2201 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rabgef1Q9JM13 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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